El enfoque en el trabajo académico le da al II UNAM un sello único frente a otras dependencias de la UNAM, y para esto, cuenta con una infraestructura moderna de 32 laboratorios que lo hace la dependencia más grande de la Universidad en este aspecto particular.
En los laboratorios, que están equipados con tecnología de punta, trabaja un gran número de académicos y estudiantes de licenciatura y posgrado que han hecho posible mantener el prestigio del II UNAM, cumpliendo como función principal la de realizar investigación en ingeniería de calidad, original, útil y altamente competitiva preservando el papel de árbitro nacional de la ingeniería y actor principal del desarrollo tecnológico de México.
La probada capacidad técnica de estos laboratorios se confirma con el importante patrocinio que reciben por estudiar y proponer soluciones técnicas a los problemas que enfrentan instituciones y empresas del sector público y privado.
