El IIUNAM fortalece sus relaciones con la industria, organismos públicos, privados e Instituciones de Educación Superior, a traves del establecimiento de convenios, mediante los cuales se realizan proyectos de investigación, prestación de Servicios o convenios de colaboración
Participamos de manera activa en proyectos patrocinados por diversas dependencias gubernamentales como los Centros Mexicanos de Innovación en Energía, en donde el Instituto de Ingeniería lidera el CEMIE-Océano y colabora en el CEMIE Bio, Geo y Sol.
Colaboramos también en otros proyectos con instituciones como la Comisión Nacional del Agua; el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología; la Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación; Petróleos Mexicanos; Secretaría de Comunicaciones y Transportes; Centro Nacional de Prevención de Desastres; Secretaría de Medio Ambiente y Recursos Naturales, entre otros.